Sinopsis

U.C. 0097, satu tahun setelah pembukaan "Kotak Laplace." Meskipun terungkapnya Piagam Abad Universal yang mengakui keberadaan dan hak-hak Newtype, kerangka dunia belum banyak berubah. Konflik yang kemudian dijuluki "Insiden Laplace" diperkirakan berakhir dengan jatuhnya sisa-sisa Neo Zeon yang dikenal sebagai Sleeves. Dalam pertempuran terakhirnya, dua mobile suit psycho-frame penuh menunjukkan kekuatan di luar pemahaman manusia. Unicorn putih dan singa hitam disegel untuk menghilangkan bahaya ini dari kesadaran manusia, dan sekarang seharusnya dilupakan sepenuhnya. Namun, RX-0 Unicorn Gundam 03, yang menghilang dua tahun sebelumnya, kini akan muncul kembali di Bumi. Seekor phoenix emas... bernama Phenex.