Sinopsis

Pada tahun 0096 di Abad Universal, perdamaian yang rapuh muncul dari abu konflik. Siswa berusia enam belas tahun Banagher Links mengunjungi koloni luar angkasa Industrial 7 dalam perjalanan wisata sekolah, tetapi karena pesawat ulang-alik yang rusak, ia terdampar sepenuhnya. Bagi Banagher, yang selalu menjalani kehidupan normal, perang selalu menjadi bagian sejarah yang jauh dan hampir mistis; tetapi dalam hitungan menit, fantasi menjadi kenyataan ketika ia menyelamatkan seorang gadis bernama Audrey Burne, yang sangat perlu bertemu dengan pemimpin Yayasan Vist di dekatnya, Cardeas Vist. Ia berharap dapat membujuknya untuk menahan "Kotak Laplace," sebuah objek yang berpotensi menghancurkan dunia. Sejarah dimulai saat pasukan galaksi berkumpul di Industrial 7, masing-masing berlomba untuk memiliki Kotak Laplace. Saat sisa-sisa Neo Zeon bentrok dengan Pasukan Federasi Bumi di sekitar koloni, Cardeas, di saat-saat terakhirnya, memberikan Banagher kunci Kotak, sebuah baju bergerak yang dijuluki "The Unicorn Gundam." Dipenuhi dengan aksi yang meledak-ledak dan ketegangan yang meningkat, Mobile Suit Gundam Unicorn RE:0096 mengikuti Banagher saat keyakinannya diuji dan takdir yang telah terpendam selama lebih dari satu abad akhirnya terwujud.